Conformément à l'art. 26 de la loi sur les EPF, le Conseil des EPF dispose d'un état-major; ce dernier conseille et assiste le président du Conseil des EPF dans son activité de direction.

La direction administrative du Conseil des EPF est assurée par Michael Käppeli. Dans sa fonction de directeur administratif, et en collaboration avec les services de l'état-major, il conseille et soutient le Conseil des EPF. Michael Käppeli apporte en particulier son appui au président dans l'exercice de ses fonctions de direction stratégique et de surveillance définies par la loi.

Organisé en différents services, l’état-major du Conseil des EPF collabore étroitement avec les institutions du Domaine des EPF et avec les autorités fédérales. Les champs de responsabilité des différents sevices de l'état-major sont mentionnés sur les pages concernées de ce site.